課程大綱

課程資訊

課程名稱	基因體與基因體學 GENOME AND GENOMICS
開課學期	96-2
授課對象	生命科學院生命科學系
授課教師	林白翎
課號	PlBio5017
課程識別碼	B42 U1170
班次
學分	3
全/半年	半年
必/選修	選修
上課時間	星期五6,7,8(13:20~16:20)
上課地點	生科3A
備註	總人數上限：40人
Ceiba 課程網頁	http://ceiba.ntu.edu.tw/962gng2008
課程簡介影片
核心能力關聯	核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
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課程概述	基因體定序為生物學開創了一個新紀元。這項前所未有的浩大工程將生物學與高通量自動化科技及資訊學相互整合。遺傳密碼的解讀帶來分子遺傳學及生物學的新知，並指出學術研究與科技應用的新方向。本課程針對這些科技與新知逐一闡述。內容包括： 1. 序論 2. 基因體結構 3. 定序科技 4. 比較基因體學 5. 基因抑制：基因體及個別基因的突變研究 6. 基因表現總覽與高通量弁鈰穧]體學研究 7. 蛋白質體學與蛋白質結構體學 8. 遺傳迴路：轉錄調控及蛋白質交互作用網絡 9. 新陳代謝體學及總體生化網絡 10. 微生物及胞器的基因體 11. 真核生物模式系統的基因體 12. 人類基因體 13. 基因體學與疾病研究 14. 基因體學與化學藥物篩選及設計 15. 基因體學與生物醫藥研發 16. 基因與細胞治療 17. 基因體學研究的倫理、法律與社會議題
課程目標	明瞭基因體學的內涵、時代意義、及其對科技與文明的影響，找出學生個人志趣與所習課目的關聯，培養由知識衍生的使命感，共創人類光明遠景。
課程要求	學生須具備基礎生物學及分子生物學的知識，探討學術與科技的承先啟後、跨領域的整合，培養主動求知的習慣，建立前瞻研究的視野與能力。評分方式：筆試 40% (期中考、期末考各20%)，報告 40% (文獻摘錄、研究計畫各20%)，課堂討論 20%
預期每週課後學習時數
Office Hours
指定閱讀
參考書目
評量方式 (僅供參考)

課程進度

週次	日期	單元主題
第1週	2/22	簡介
第2週	2/29	課程概述、基因體及基因體學定義、基因體定序簡史
第3週	3/07	基因體結構、定序科技總覽、課程專題討論 Textbook: Principles of Gene Manipulation and Genomics (PGMG) Chapter 16
第4週	3/14	基因體輿圖、分子標誌、生物資訊 PGMG Chapters 7, 9, 17
第5週	3/21	比較基因體學、基因抑制(一) PGMG Chapters 8, 12, 13, 14, 15, 18
第6週	3/28	基因抑制 (二)、高通量基因表現分析 PGMG Chapters 19, 20
第7週	4/04	國定假日
第8週	4/11	專題報告 Human Diversity, Evo-devo, Transcriptome Analysis and Comparison、蛋白質體學與蛋白質結構體學 PGMG Chapters 21, 22
第9週	4/18	遺傳網絡 PGMG Chapter 23、專題報告 RNA Interference
第10週	4/25	新陳代謝體學及總體生化網絡 PGMG Chapter 24、專題報告 Algarithm, Reverse Genetics
第11週	5/02	基因體學與疾病研究: 感染症、遺傳疾病、癌症; PGMG Chapter 25; Textbook: Genomics: Applications in Human Biology (GAHB) Chapters 3, 4, 5; 期中考; 基因體學辭彙
第12週	5/09	期中考調課
第13週	5/16	專題報告Mycobacterium spp. and TB、HIV targeted by RNAi; 基因體學與癌症、生物醫藥量產 GAHB Chapters 5,6
第14週	5/23	專題報告 Drugs、Artificial Organism; 基因體學與藥物開發、生物醫藥量產 GAHB Chapters 6,7
第15週	5/30	專題報告　Stem Cell Reprogramming; 基因與細胞治療、人類基因體學研究的倫理、法律、與社會議題　GAHB chapter 8; PGMG Chapter 26
第16週	6/06	專題報告 Stem Cell Reprogramming、Gene and Cell Therapy; 微生物與胞器基因體、真核模式系統基因體、人類基因體學研究的展望
第17週	6/13	調課: 基因體學研討會
第18週	6/20	期末考